Jak wskazuje wieloletnie doświadczenie w obrocie towarowym z zagranicą, korzyść w postaci deklarowanego przez Organ Celny zmniejszenia ilości kontroli zgłoszeń i towarów dla posiadaczy AEO nie jest stosowana automatycznie i bezwzględnie przez Urząd Celny.

Z perspektywy lat liczba podmiotów posiadających AEO zdecydowanie wzrosła i w istocie jest niewiele podmiotów w tym Agencji Celnych, które nie posiadają takiego statusu.

Należy pamiętać, że zawsze ustanowienie kontroli na konkretnych zgłoszeniach jest wynikiem analizy danych zawartych w zgłoszeniach przede wszystkim przez sam system. Dzieje się to więc automatycznie. Kontrole są w takim wypadku  generowane przez wzbudzenie „zaszytych” w systemie AIS algorytmów kontrolnych. Są one ukierunkowane np. na konkretne towary, kraje pochodzenia lub nadawców itp. Oczywiście informacja o statusie AEO jest również brana pod uwagę przy kontroli automatycznej, jednakże z naszych obserwacji wynika, że czynnik ten ma mniejszą wagę niż inne badanie informacje.

Ponadto w dzisiejszych realiach, przy istniejących ograniczeniach przywozu i wywozu wielu grup towarowych objętych sankcjami ze względu na agresję Rosji i Białorusi częstotliwość kontroli towarów – zwłaszcza na granicy wschodniej jest znacząco wyższa.